免费显微图像采集与分析软件

说到显微镜系统的软件，大部分同学的印象和反映是下面这样的共聚焦软件：专业的黑色背景、复杂的控制界面、丰富的采集和分析功能等。非常高大上！

但是同学们一般都喜欢免费开源的软件，在自己的笔记本电脑上也能用，分析处理显微图像数据。相信生命科学领域的同学们都听说过ImageJ这个免费软件，但是头痛的是ImageJ插件太多需要自己下载安装。今天我们推荐Fiji这个软件包，其实就是ImageJ的汇集，网站地址 www.fiji.sc

在Fiji软件包里，更容易找到各种图像分析功能，使用简单方便。

上面提到的ImageJ还有Fiji软件包，都是免费的软件，但是专注于图像分析。如果同学们需要免费的软件做图像采集，比如控制科研相机或者其他检测器来采集图像信号，我们推荐Micro-Manager这款软件。Micro-Manager支持的显微硬件非常多，包括各种科研显微镜、周边产品比如激光器、光源、相机、电动载物台等等。用这套免费软件，可以构建一套完整复杂的活细胞显微成像系统。网站地址

在神经科学电生理应用领域，荧光信号（主要是钙染料）的采集和膜片钳电流或电压信号的采集需要同步，并且钙荧光信号需要实时显示曲线。WinFluor这套免费软件就是给这个用途的，并且支持较多的显微周边硬件。网站地址 http://spider.science.strath.ac.uk/sipbs/software_winfluor.htm

在神经科学领域，更的显微成像需求是双光子成像，这个需求也有免费开源的软件可以使用，就是基于matlab开发的ScanImage软件包。网站地址