在实验室环境中分析细胞时，
流式细胞仪是一种广泛使用且全面的单细胞分析方法。它一种集激光技术、电子物理技术、光电测量技术、电子计算机技术、细胞荧光化学技术和抗原抗体检测技术为一体的新型高科技仪器。流式细胞仪分类：
1. 分析型流式细胞仪
用于快速分析检测细胞组分及颗粒悬液，通过同时检测分析液流中细胞上多种信号，对细胞加以细致的区分鉴别，临床检验主要使用此类流式细胞仪，例如BriCyte E6、Calibur、Canto、FC500、Navios、NovoCyte等系列，均已拿到CFDA注册证。此外还有CyFlow、CytoFLEX、Gallios、Guava、LSR、MACSQuant等各类配置的科研型流式细胞仪。
2. 分选型流式细胞仪
用于快速分离获取目的细胞，在分析检测基础上，通过分选模块对细胞加以分离。电荷式分选是目前主流的分选方式，具有分选效率、纯度高，不易污染等特点，例如Aria、InFlux、MoFlo Astrios EQ、MoFlo XDP、S3等流式分选仪。
3. 全自动式流式细胞仪
根据临床常规检验的需求，临床型流式细胞仪向着更自动化的操作流程和更好的生物安全性能发展。为了进一步简化临床操作，全自动式流式细胞仪具有自动样本加样、溶血、检测，检测结果通过双向LIS自动上报等类似的全自动化功能，即人工放入血样管，无需下一步人工干预，仪器就能得到结果，大大提高了实验室的工作效率和管理效率，减少可能的人为错误。如Aquios CL、AutoCyte等全自动流式细胞仪。
4. 图像型流式细胞仪
将流式多色检测技术和荧光显微镜图像显示技术相结合的一种流式细胞仪，通过荧光信号的强度以及荧光图像对细胞亚群进行定性和定量分析。如ImageStream系列成像流式细胞仪。
