广告招募

当前位置:全球工厂网 > 技术中心 > 所有分类

重组菌株高通量涂布:声波移液的创新解决方案

2025年12月31日 08:28:39      来源:贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司 >> 进入该公司展台      阅读量:0

分享:

合成生物学是一门基于工程化原理设计、构建和优化生物系统的新兴交叉学科。分子克隆是合成生物学的基础技术,而平板涂布作为分子克隆中的核心步骤,对确保重组质粒纯度和实验可重复性至关重要,但传统手工涂布(96样本/96平板)需90分钟,自动化系统(如QPix 460)仍需30分钟,通量不足且耗材量大,制约高通量应用,亟需开发高吞吐、低耗材的微型化涂布新技术。


Echo®移液系统采用动态流体分析(Dynamic Fluid Analysis™,DFA)和声学微滴喷射(Acoustic Droplet Ejection,ADE)的技术(U.S.Patent 6,938,995),该技术无需吸头,使用非接触式移液的方式完成nL级体积的菌液至固体培养基的转移,极大地提高涂布实验的效率,同时降低耗材和硬件成本。

图片

Echo525产品特点:

nL级移液,减小反应体系,节约样品和试剂成本;

无需吸头等耗材,更低的耗材成本;

无液体残留,更高的移液准确度,更低的移液CV值;

非接触移液,消除交叉污染;

灵活移液,可从来源板任意孔移液至目的板任意孔;

快速移液,3分钟内完成25nL 384孔板的移液。

实验设计-从头构建质粒与Echo高通量平

图片

采用同源序列引物分别扩增载体PL2214(9330bp)及目的片段C(1443bp)、D(1581bp)、E(1656bp),通过同源重组构建重组质粒。每组基因设两个平行(C1/C2、D1/D2、E1/E2),以减少实验误差,确保结果的可靠性。将C1/D1/E1菌液进行梯度稀释(原液、10×、20×、50×);C2/D2/E2菌液浓缩10倍后稀释(原液、10×、50×、100×),共制备24个稀释样本。使用Echo 525将稀释菌液以25nL/液滴转移至384孔PP板,每个样本点样48个单克隆至含Amp的LB 8格板。

图片

图1:Echo 525平板涂布软件方法设置

Echo Plate Reformat软件:

界面友好,填空以及鼠标点选的编写方式;

自带移液模板,支持多种溶液类型同时移液;

灵活移液,支持来源板任意孔到目的板任意孔的移液;

数据追踪,自动生成移液报告。

实验结果:

本应用方案成功建立了基于声波转移的高精度菌落阵列构建方法:

针对3种质粒构建体系,分别设置8个梯度稀释条件,通过Echo 525非接触式转移系统将每个样品以48个25nL液滴(共计1.2μL/样品)精准分配至SBS标准8格板。实验证实:

01

原液直接涂布即可获得有效单克隆;

02

10倍浓缩菌液产生的单克隆数量显著高于未浓缩组。

图片

图2:使用Echo 525做平板涂布,平板上长出的单菌落

菌落PCR验证结果:

随机挑选18个单菌落做菌落PCR,17个扩增出特异性目的条带(阳性率94.4%),1个无扩增,所有产物送测序验证。

图片

图3:菌落PCR电泳结果

测序验证结果:

17个阳性PCR产物经测序分析,均显示纯净单峰,序列与预期匹配,证实17个菌落均为目标单克隆,测序结果与菌落PCR检测结果一致。

图片

图4:一代测序验证单克隆

本研究通过菌落PCR和测序验证了Echo 525涂布系统的单克隆可靠性:

在18个随机挑选的克隆中,94.4%(17/18)呈现单一目的条带和纯净测序峰图,证实该系统产生的菌落均为单克隆。基于此,我们建议优化工作流程:

01

直接使用收菌后浓缩10倍的菌液进行Echo涂布,可提升操作效率;

02

根据实际转化效率,可适当减少单样本转移液滴数量(当前48滴/样本)。该方案质粒构建成功率显著高于常规方法。

结论

Echo 525适配高通量菌株构建实验体系,解决平板涂布耗时长、效率低、耗材使用量大等问题,以构建96个重组质粒的平板涂布为例:

一. 效率提升:

图片

*按照每个样本转移12个菌液液滴计算

二. 成本优化

01

耗材节省

平板用量:Echo525仅需3块SBS标准板(vs手工96块板/QPix 12块8格板)

- 较手工降低97%(96板→3板)

- 较QPix降低75%(12板→3板)

辅助耗材:零吸头消耗(传统方法需96个无菌吸头)

02

硬件需求节省

与手工涂布或QPix 460涂布相比,Echo高通量平板涂布所需的温控培养箱数量减少97%或75%,大大降低了温控培养箱的硬件成本。


版权与免责声明:
1.凡本网注明"来源:全球工厂网"的所有作品,版权均属于全球工厂网,转载请必须注明全球工厂网。违反者本网将追究相关法律责任。
2.企业发布的公司新闻、技术文章、资料下载等内容,如涉及侵权、违规遭投诉的,一律由发布企业自行承担责任,本网有权删除内容并追溯责任。
3.本网转载并注明自其它来源的作品,目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点或证实其内容的真实性,不承担此类作品侵权行为的直接责任及连带责任。其他媒体、网站或个人从本网转载时,必须保留本网注明的作品来源,并自负版权等法律责任。 4.如涉及作品内容、版权等问题,请在作品发表之日起一周内与本网联系。