分子短程蒸馏装置相比传统的长程蒸馏设备，短程蒸馏装置能够在较小的体积内完成更高效的分离。这种紧凑的结构使得蒸发和冷凝过程更快速，同时减少了混合物中组分之间的相互作用和反应，有助于提高产品纯度。
分子短程蒸馏在高真空条件下进行，利用不同物质分子运动的平均自由程差异来实现混合物的分离。具体来说，液体混合物被加热至一定温度后，轻组分的分子会从液面逸出，并直接飞射到冷凝面上凝结，而重组分则由于平均自由程较短无法到达冷凝面，从而实现分离。这一过程中，分子从液相主体向蒸发表面扩散，再在液层表面上自由蒸发，随后从蒸发表面向冷凝面飞射，然后在冷凝面上冷凝。
分子短程蒸馏的操作条件：
温度：分子短程蒸馏的操作温度远低于物质的沸点，特别适合热敏性物质的分离。温度过高会导致组分分解，温度过低则会影响分离效果。
压力：压力的控制也非常重要，因为不同组分的沸点与压力有关。在实验中，通常会使用真空泵来降低压力，以便在较低的温度下进行蒸馏。当操作真空度约为500Pa时，可以在刮膜蒸发器或降膜蒸发器中进行。但分子蒸馏是在1Pa~0.01Pa高真空下进行的特殊蒸馏过程。
