分子蒸馏设备可用于工业化生产的液-液分离技术，能解决大量常规蒸馏技术所不能解决的问题。分子蒸馏被认为是较高效的分离方式，它可以用来提纯热稳定性差的分子以及低挥发性、高沸点的相关化合物。在高真空环境下，分子蒸馏的特点是蒸馏温度低，物料受热时间短，可快速进行分离，应用于石油化工，医药化工，精油提纯，化妆品香水提纯等多个领域。
分子蒸馏设备是将待分离的化合物先在沸点下气化变成气体，气态的化合物在真空泵的作用下被整体抽出，流经冷凝器的时候才可以获得冷凝。冷凝器与蒸发面之间过长的距离，使得该段距离间充满了气态化合物，因而难减小蒸发液面处的压力。对于分子蒸馏，由于冷凝器与蒸发表面布置得紧密，待分离的化合物一旦挥发逸出，便被冷凝，因而冷凝器与蒸发器表面之间的气态化合物分压低，可以实现低压下的化合物分离。
该设备时在真空下操作，能使液体在远低于其沸点的温度下将其分离，特别适用于高沸点、热敏性及易氧化物系的分离，保护了热敏物料的品质。尤其用于天然保健品等的提取，可摆脱化学处理方法的束缚，真正保持了*的特性。也可用于分子量接近但性质差别较大的物质的分离，如沸点差较大、分子量接近的物系的分离，但是分子蒸馏不适宜于同分异构体的分离。
