全自动装盒机是将药瓶、药板、药膏等和说明书自动装入折叠纸盒中，并完成盖盒动作，部分功能较全的自动装盒机还带有贴封口标签或进行热收缩裹包等附加功能。全自动装盒机进料一般分为三个入口：说明书入口、药瓶入口和机包盒入口。从机包盒进料到最后包装成型的整个过程大致可以分成四个阶段：下盒、打开、装填、合盖。下盒动作通常是由一个吸盘从纸盒进料口吸取一个纸盒，下行到装盒的主线上，由一个导轨卡位将纸盒固定并用一个推板打开纸盒，同时会有两个可向前移动的卡位从下面升起，从前后方向卡住纸盒的侧面，使盒子打开成直角并前移到装填区域。在装填区域填装后，机器的机构会将耳朵折进左右的导轨中，然后再进行合盖动作。合盖前机构会先弯折纸盒的插舌，然后有一推板推动盒盖弯折，使插舌插进盒子中并使锁扣扣紧。合盖动作是个关键性的动作，完成的好坏与纸盒的结构和机器调节的准确程度有很大关系。

间歇式装盒机的传动机构间断运行，其速度为80-100盒/分，一般在50-80盒/分。具体分析如下：
主传动靠分度器或刹车垫机式线每个循环的运动和停留。
  1．主传动停留时间内，在整个传送链中，产品落入静止的产品传送链上的船中，开盒系统为单头往复式，盛放纸盒的仓中最多存放200个纸盒，单吸头吸下纸盒靠静止的盒传送链的链条及挡板打开纸盒，放入链条上，单吸头返回，速度慢；折纸机吸下的说明书间断送至产品船下面，纵向固定的推杆系统横向将产品推入纸盒中，推杆再返回原位；横向固定的封盒系统，将纸盒关闭，再返回原位。
  2．主传动运动时间内，产品传送链运动，将船中的产品依次送至折纸机和开盒系统的吸头下面，折纸机不动作，推杆不动作，封盒系统也停止动作。