彩色丝网印刷的色序排列一般为黄、青、品红和黑。考虑到工艺要求，也有将色序排列为青、品红、黄和黑的。国外也有按黑、黄、品红、青为印刷色序的，由于丝网印刷中承印物形状的不同（平面、曲面之分）以及承印物材料性质的不同，色序也有所不同，例如在透明物体上印刷时，色序排列应该是黑、黄、青、品红。色序的排列对反映原稿色彩有着重要制约关系，如何保证复印物色彩不失真，除要正确掌握油墨的使用外，还需要长期工作实践及经验积累，去不断摸索总结。
确定丝网印刷色序要考虑两种因素，其中一种因素是承印物上的印墨的透明度如何，这是两因素中的主要因素。由于在丝网印刷中是通过各种颜色的油墨混合或叠合而产生新的色彩的油墨，如果承印物上印墨透明度差，在印刷第二色时就会将色墨迹盖住，而不能与第二色合二为一生成新色。第二个因素是人的眼睛对各种色彩感受的能力是不相同的。一般来说，人的眼睛对品红色最敏感，青色次之，对黄色敏感性最差。由于人们对颜色敏感性有差别，往往造成对黄色网点的扩大或缩小，丢失和墨量大小的变化分辨不清，从而影响印刷质量。
正确的丝网印刷工艺程序及要求是，色用青色版印，印好后，用梯尺、色标进行阶调再现的对比检查。第二色用黄色版印刷，这样两色叠合成绿色，然后利用人的眼睛对绿色调识别能力强的特点，对照梯尺、色标检查印刷质量。第三色用品红色版印刷，最后用黑色版。黑色版可加强轮廓和暗调层次。四色版印完后就得到与原稿相同的彩色复制品了。
