福建农业区划研究所和福建农林大学、省农业联合承担的《香菇烂筒生态调查和综合防治示范推广》项目中，经环境调查和分离的致烂菌丝回接试验分析认为，造成香菇烂筒的原因是致烂菌和环境因子共同造成，环境因子主要是温度和湿度对香菇菌丝生长的适应度。环境条件越适宜香菇菌丝生长，导致烂筒的机会就越少。由于高温使香菇菌丝停止生长，活力减弱，特别是具有保湿、保湿、防杂菌的菌被尚未形成时，杂菌容易入侵；菌筒直接接触大田土壤，当温湿度适宜香菇菌丝生长时， 有利于抑制某些习性为高温、高湿、好氧的杂菌；当温、湿度不适合香菇菌丝生长时，会促使杂菌的繁殖，加速烂筒的发生。夏季菇场长期灌水和人工浇水，菇农本意是降温保筒出菇，但不如此造成空间和土壤高湿，因水的热传递比空气快得多，导致菌筒的温度接近于气温，覆土和灌水又造成通气不良，使香菇菌筒缺氧窒息，所以加剧了烂筒的发生和发展。