装料制袋一般用自动装袋机，该机套筒为不锈钢，筒径可调，设有微电脑控制系统，离合器，红外感应开关。将抖好的培养料装进料斗后，用一端开口的塑料袋套在套筒上，触控红外开关，装袋机自动将培养料装入袋内。装好的袋呈长筒形，用干毛巾刷清袋口和外壁上的培养料，用铝卡式自动扎口机扎封，装袋口培养料清刷干净，有利于防止杂菌由此入侵。

日产10000筒以下的栽培者，只需一台装袋机，配备3-4人操作。劳力可作如下安排：一人铲料上机，一人递袋，一人装袋，一人扎袋口。操作中应轻拿轻放，不拖不磨，避免人为损坏菌袋。制袋10000筒，一台装袋机，3-4人操作通常8小时即可完成。

香菇装料时，尽量把培养料装紧，60厘米首袋装入60%含水量的木屑培养基，装料成为43厘米左右长度的菌筒，重量在1.9-2.0千克。菌筒的培养料若装得太松，菌筒容易断裂，在打穴接种时，容易因空气进出量增加而增加污染机会，菌丝在透后，菌筒收缩严重，培养料与塑料膜间隙加大，造成菌丝徒长，菌膜加厚。

装料后的菌筒，应当以五指抓起有硬度感，中等用力不会凹陷为宜。如手提料筒有凹陷感，或两端下垂，培养料出现断裂痕迹，说明装料太松，这时需要调切自动装袋机的松紧传感器。