生物离心机采用机械旋转式真空泵和油扩散泵两真空系统，真空度可达到10-3mmHg，这样就大大地减少了空气的磨擦阻力和摩擦所产生的温度升高。为了离心腔内的真空度，预冷的转子装到旋转轴上之要把表面的霜雾水分擦净，再装入离心室，然后启动真空泵抽真空。
另外，在工作过程中，会有一些水分浸入瓢泵内与油混合。所以在每次检修时，要将真空泵底部的排油开关打开，把水排放出来，而后将附件漏斗插入排油口乙烯管中，加注MR一100真空油，一直加到油位观察中心标线高度若在排水之发现油太脏、发黑，刚应全部将其放出更换。做完上述检修后，接着检查聚油槽下面的乙烯管内是否积满油。如发现积油，说明油霉分离器被堵塞，这样就需要将油雾分离器顶母螺丝拧下，拆下顶盖，抽出滤芯更换。离心腔内的真空度是否良好，除与真空泵的本身性能和故障有关外，还与仪器机门的密封橡胶圈、轴封套和管道的密封有关。发现漏气要立即修理，特别是对一些不太注意的部位和接口处更要仔细检查。
为加强实验室管理，确保生物离心机的功能和运行正常，实验室质量体系的有效运转，可定期对其进行自检，一般程序如下：
1、外观应无损坏，无零配件丢失。
2、电源连接应良好，开关控制状态应良好。
3、启动仪器后，离心机应正常工作。各种参数的设置功能如设定温度、设定时间、设定离心速度、设定转子状态等功能正常。
4、离心效率校验：取一只装有5mL血样的离心管，以5000转/分钟、10000转/分钟、15000转/分钟和20000转/分钟几种状态下离心5分钟，分别检验在不同离心速度下的固体和液体分离状态，随着离心速度的增大，分离效果应越来越好。
5、温度校验：分别设定好三种不同的温度值，如：5℃、10℃和15℃，在同样的离心速度下，离心10分钟后，取出离心管，分别用温度计间量离心管内溶液温度，与设定值对比误差应不超过±1℃。
6、时间校验：根据其他准确时间表和仪器设定时间对比，误差应不超过±0.1min。
