短程分子蒸馏装置是根据分子蒸馏的原理而设计的，是模拟分子蒸馏的模型，由于其加热面和冷却面的距离很近，阻力很小，故称短程蒸馏，不同于传统蒸馏依靠沸点差分离原理，而是靠不同物质分子运动平均自由程的差别实现分离。
由于内置冷凝器的作用，能把汽化的汽相瞬间液化，收缩体积，因此能维持设备内部的高真空。短程蒸馏器的操作真空可达1Pa，是其他蒸发、蒸馏设备难以达到的，因此，短程蒸馏特别适用于常压下高沸点，用普通分离方法难以分离的物料，作为一种新型的液--液分离设备已有很多行业得到了成功经验。
短程分子蒸馏装置需具备的条件是：
1、残余气体的分压须很低，使残余e气体的平均自由程长度是蒸馏器和冷凝器表面之间距离的倍数。
2、在饱和压力下,蒸汽分子的平均自由程长度需要与蒸发器和冷凝器表面之间距离具有相同的数量级。
在这此理想的条件下，蒸发在没有任何障碍的情况下从残余s气体分子中发生。所有蒸汽分子在没有遇到其它分子和返回到液体过程中到达冷凝器表面。蒸发速度在所处的温度下达到可能的大值。蒸发速度与压力成正比，因而，分子蒸馏的馏出液量相对比较小。
在短程蒸馏中，冷凝器和加热表面之间的距离约为20~50mm,残余气体的压力为10-3mbar时，残余气体分子的平均自由程长度约为2倍长。短程蒸馏器能满足分子蒸馏的所有必要条件。
